More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0314 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  63.05 
 
 		 254 aa  315  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  61.6 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  60.4 
 
 		 264 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  59.59 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  59.84 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  61.07 
 
 		 250 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  61.07 
 
 		 254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  59.6 
 
 		 250 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  60 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  60 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  61.6 
 
 		 254 aa  307  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  59.02 
 
 		 260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  62.4 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  59.6 
 
 		 241 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  59.6 
 
 		 241 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  59.6 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  62 
 
 		 269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  58 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  59.2 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  60 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  56.45 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.8 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.48 
 
 		 242 aa  298  8e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.4 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59.59 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  56.68 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.4 
 
 		 241 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.4 
 
 		 241 aa  295  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 254 aa  293  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  57.2 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.54 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  57.6 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.77 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  57.55 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 244 aa  291  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  56.57 
 
 		 279 aa  291  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  59.44 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60.66 
 
 		 240 aa  291  9e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  57.83 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  56 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  55.6 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  58.4 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.73 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  60.57 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  59.18 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  56.8 
 
 		 256 aa  289  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.3 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.08 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.95 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.6 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.96 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  57.38 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.54 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.33 
 
 		 242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.96 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  57.38 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  58.4 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.2 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  58.1 
 
 		 243 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.4 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.6 
 
 		 263 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.2 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  55.56 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  55.42 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  56.5 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  55.56 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  53.82 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.54 
 
 		 242 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.55 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.55 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06900  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.16 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.61 
 
 		 249 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.15 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 		 253 aa  279  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  56 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  58.4 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  56.4 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.02 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.8 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.32 
 
 		 594 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>