More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0468 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  73.75 
 
 		 252 aa  355  3.9999999999999996e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  69.87 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  69.46 
 
 		 242 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  65 
 
 		 240 aa  321  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.5 
 
 		 244 aa  320  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 		 240 aa  318  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.08 
 
 		 244 aa  314  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  62.5 
 
 		 240 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  65.83 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 240 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.08 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.17 
 
 		 245 aa  308  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  308  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  307  9e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.67 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  62.76 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.25 
 
 		 246 aa  305  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  59.17 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  64.53 
 
 		 242 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 242 aa  304  9.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.33 
 
 		 244 aa  304  9.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.5 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  63.68 
 
 		 242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 240 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.92 
 
 		 278 aa  300  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  60.17 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  62.24 
 
 		 241 aa  297  8e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 257 aa  297  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.58 
 
 		 239 aa  297  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  296  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.02 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  296  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  60.73 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  60.83 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  62.5 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  58.09 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  62.5 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  62.5 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  58.75 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.09 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  58.75 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  58.92 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.33 
 
 		 246 aa  295  6e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  60.85 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.55 
 
 		 273 aa  294  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 240 aa  294  7e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 242 aa  294  8e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  294  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  59.17 
 
 		 241 aa  294  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 240 aa  294  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  62.34 
 
 		 255 aa  294  9e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.74 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.02 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  58.4 
 
 		 255 aa  293  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  292  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.17 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.58 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  292  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  58.33 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  58.92 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  59.17 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 284 aa  292  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  61.09 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  57.32 
 
 		 252 aa  291  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  59.58 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>