More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0598 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.93 
 
 		 242 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.93 
 
 		 242 aa  394  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  78.51 
 
 		 242 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  75.21 
 
 		 242 aa  376  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 242 aa  363  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.14 
 
 		 242 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  71.07 
 
 		 242 aa  359  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  64.46 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  64.73 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  301  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  60.42 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 247 aa  298  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  57.68 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  56.43 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.2 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 244 aa  288  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.92 
 
 		 252 aa  288  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  54.81 
 
 		 363 aa  288  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  54.81 
 
 		 363 aa  288  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  55 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  55.23 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  55.23 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  57.08 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.19 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.58 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.94 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.08 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.39 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  56.25 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.83 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.92 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.17 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  55 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  53.14 
 
 		 360 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  54.36 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  55.23 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  52.72 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 		 257 aa  278  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 274 aa  278  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  54.32 
 
 		 243 aa  277  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  54.17 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  55.42 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  51.25 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  55 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.77 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  54.17 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  50.42 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  54.73 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  52.08 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.81 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 		 284 aa  274  7e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  53.69 
 
 		 244 aa  274  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  56.2 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  55.79 
 
 		 248 aa  274  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  53.31 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  53.31 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  53.72 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  55.79 
 
 		 245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  58.59 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  52.07 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>