More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3744 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3744  ATPase  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.54 
 
 
242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  60 
 
 
240 aa  305  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.11 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  60.83 
 
 
243 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.41 
 
 
244 aa  298  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  57.32 
 
 
255 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.42 
 
 
244 aa  296  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 
241 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  58.92 
 
 
244 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60 
 
 
240 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.17 
 
 
253 aa  295  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60 
 
 
245 aa  295  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.76 
 
 
249 aa  294  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 
269 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  61.25 
 
 
278 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 
240 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  292  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  292  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  292  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  292  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  60 
 
 
243 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 
249 aa  291  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  58.75 
 
 
253 aa  291  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  291  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  56.9 
 
 
258 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  56.9 
 
 
258 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  56.49 
 
 
267 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  59.34 
 
 
241 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60.42 
 
 
240 aa  290  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  56.9 
 
 
269 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  60.82 
 
 
252 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  61.25 
 
 
253 aa  289  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
241 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.82 
 
 
256 aa  289  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
253 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.92 
 
 
244 aa  288  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.33 
 
 
253 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  55.47 
 
 
263 aa  288  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
242 aa  288  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 
243 aa  288  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  60 
 
 
246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60 
 
 
239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.67 
 
 
241 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.67 
 
 
241 aa  288  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  57.32 
 
 
266 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  56.79 
 
 
246 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  287  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.67 
 
 
241 aa  287  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 
241 aa  287  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  56.85 
 
 
244 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  56.79 
 
 
255 aa  287  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 
268 aa  287  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 
251 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  56.38 
 
 
247 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56.67 
 
 
242 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  60.17 
 
 
257 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.75 
 
 
244 aa  286  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.33 
 
 
245 aa  286  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
244 aa  286  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  55.19 
 
 
246 aa  286  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.08 
 
 
242 aa  286  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  55.65 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  56.61 
 
 
246 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  55.23 
 
 
257 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  285  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  285  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  58.12 
 
 
246 aa  285  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.73 
 
 
256 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  57.68 
 
 
242 aa  285  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.08 
 
 
242 aa  284  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  284  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  60.25 
 
 
248 aa  284  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  61.09 
 
 
253 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  60.57 
 
 
266 aa  284  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.75 
 
 
242 aa  284  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  54.66 
 
 
249 aa  284  9e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  56.49 
 
 
258 aa  284  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  284  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  284  9e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  55.79 
 
 
246 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.61 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  60.57 
 
 
266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  56.02 
 
 
245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  61.22 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  59.5 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>