More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3012 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  100 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  74 
 
 		 255 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  71.75 
 
 		 267 aa  374  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  67.29 
 
 		 260 aa  362  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  67.29 
 
 		 260 aa  362  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  70.24 
 
 		 254 aa  359  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  68.68 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  67.74 
 
 		 254 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  62 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58.47 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.6 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.18 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.2 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.87 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.47 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.81 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  55.69 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.6 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  54.47 
 
 		 257 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58 
 
 		 240 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  56.52 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  55.91 
 
 		 288 aa  278  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  54.48 
 
 		 299 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  58.87 
 
 		 260 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 		 592 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.04 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  55.6 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  56.15 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.9 
 
 		 289 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  55.6 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  55.6 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.4 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.6 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  55.56 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  53.16 
 
 		 289 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.73 
 
 		 273 aa  275  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  56.4 
 
 		 266 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.2 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.2 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  55.51 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  54.72 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  53.85 
 
 		 261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  54 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.2 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.2 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.2 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  56.85 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  51.55 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  57.26 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  56 
 
 		 266 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.91 
 
 		 595 aa  272  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.03 
 
 		 597 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  54.76 
 
 		 254 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  54.8 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  58 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  56.33 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.4 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  56.13 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.4 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  54 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  55.73 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.6 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 240 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.07 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 240 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.66 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  55.87 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  52.8 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  53.6 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.4 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.4 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5070  ABC transporter related  58.61 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  50.57 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  53.6 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>