More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4555 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  100 
 
 
299 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  86.58 
 
 
300 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  57.87 
 
 
262 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  56.04 
 
 
267 aa  291  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.63 
 
 
267 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  59.18 
 
 
260 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.25 
 
 
265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.61 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.44 
 
 
263 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 
244 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
244 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
244 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.85 
 
 
242 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
244 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
244 aa  278  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.94 
 
 
256 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0412  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  55.06 
 
 
259 aa  278  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.123929  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  54.48 
 
 
269 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
244 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 
244 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
240 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.33 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  52.23 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  54.18 
 
 
275 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  54.76 
 
 
258 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.99 
 
 
259 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  55.21 
 
 
260 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  55.21 
 
 
260 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
240 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  54.29 
 
 
244 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
240 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
240 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  55.42 
 
 
256 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
240 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
240 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.42 
 
 
256 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 
240 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 
240 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  57.32 
 
 
244 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
240 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  52.87 
 
 
244 aa  275  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  54.03 
 
 
254 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  51.82 
 
 
240 aa  275  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.87 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  53.82 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.87 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  55.56 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.03 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  53.54 
 
 
265 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  54.47 
 
 
255 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  53.67 
 
 
264 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  54.44 
 
 
253 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.63 
 
 
242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  53.41 
 
 
254 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  54.8 
 
 
258 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  52.03 
 
 
240 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
253 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  54.55 
 
 
271 aa  271  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.07 
 
 
241 aa  271  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  53.54 
 
 
261 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  51.94 
 
 
264 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  54.4 
 
 
258 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  55.02 
 
 
255 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  54.13 
 
 
263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
260 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  55.28 
 
 
254 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  55.1 
 
 
260 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  53.12 
 
 
256 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  51.12 
 
 
265 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.99 
 
 
254 aa  269  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  54.66 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  54.18 
 
 
263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  54 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  51.12 
 
 
265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.56 
 
 
268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  52.8 
 
 
265 aa  268  7e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
282 aa  268  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  51.7 
 
 
289 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
255 aa  268  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.2 
 
 
258 aa  268  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  52.4 
 
 
265 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  51.32 
 
 
289 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.8 
 
 
268 aa  268  8.999999999999999e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
254 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  52.85 
 
 
241 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  51.42 
 
 
240 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.02 
 
 
254 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.84 
 
 
249 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  52.23 
 
 
251 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1150  ABC transporter related  56.2 
 
 
251 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>