More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0153 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  538  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  59.13 
 
 
258 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  57.87 
 
 
299 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  54.88 
 
 
268 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.78 
 
 
256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.4 
 
 
300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  58.87 
 
 
253 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  54.73 
 
 
245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 
245 aa  284  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  56.18 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  58 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  56.91 
 
 
255 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.47 
 
 
263 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  53.78 
 
 
264 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  55.73 
 
 
259 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  55.73 
 
 
259 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  57.44 
 
 
259 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  55.82 
 
 
254 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0412  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  54.22 
 
 
259 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.123929  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  55.34 
 
 
259 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  56.15 
 
 
240 aa  279  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  55.82 
 
 
254 aa  279  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  55.34 
 
 
259 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  57.02 
 
 
259 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
240 aa  278  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
240 aa  278  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  54.94 
 
 
259 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  56.73 
 
 
261 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  55.34 
 
 
259 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  52.4 
 
 
255 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  52.73 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  55.64 
 
 
266 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.63 
 
 
249 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  55.64 
 
 
266 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.2 
 
 
240 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.37 
 
 
242 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.68 
 
 
254 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  54.83 
 
 
264 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  57.32 
 
 
260 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
257 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  53.97 
 
 
257 aa  275  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
264 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  53.88 
 
 
273 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
264 aa  274  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  53.49 
 
 
263 aa  274  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  56.79 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  55.82 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  56.79 
 
 
266 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  54.22 
 
 
285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  54.3 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.61 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.61 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.61 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.86 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.61 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  51.03 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  53.49 
 
 
263 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  54.76 
 
 
256 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  54.18 
 
 
248 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  53.6 
 
 
265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  56.2 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  53.2 
 
 
275 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.63 
 
 
258 aa  271  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  54.36 
 
 
254 aa  271  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.72 
 
 
241 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  53.2 
 
 
265 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.72 
 
 
241 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  53.91 
 
 
263 aa  271  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  52.78 
 
 
257 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.72 
 
 
241 aa  271  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  54.3 
 
 
274 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.26 
 
 
255 aa  271  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  54.3 
 
 
274 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.05 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  54.05 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  52.78 
 
 
257 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0575  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
261 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 
255 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  53.94 
 
 
264 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 
257 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  52.34 
 
 
265 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  54.22 
 
 
256 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  51.95 
 
 
265 aa  270  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 
241 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>