More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2411 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  99.23 
 
 
259 aa  530  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  99.23 
 
 
259 aa  530  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  95.75 
 
 
259 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  96.14 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  95.75 
 
 
259 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  93.82 
 
 
259 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  91.73 
 
 
255 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  90.16 
 
 
255 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  90.16 
 
 
255 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  89.76 
 
 
255 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  89.76 
 
 
255 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  90.16 
 
 
255 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  90.16 
 
 
255 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  89.76 
 
 
255 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  87.26 
 
 
259 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  85.71 
 
 
259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  84.05 
 
 
266 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  85.38 
 
 
264 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  82.88 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  84.25 
 
 
261 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  83.79 
 
 
264 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  81.71 
 
 
263 aa  447  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  83.79 
 
 
264 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  83.79 
 
 
264 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  83.14 
 
 
266 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  83.79 
 
 
264 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  83.66 
 
 
274 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  83.33 
 
 
264 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  83.79 
 
 
264 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  83.27 
 
 
266 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  83.27 
 
 
266 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  83.66 
 
 
274 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  83.4 
 
 
264 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  83.79 
 
 
264 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  81.71 
 
 
275 aa  430  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  75.88 
 
 
273 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4636  ABC transporter related  77.87 
 
 
255 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3727  ABC transporter related  77.87 
 
 
255 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409478  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2375  ABC transporter, ATPase subunit  77.08 
 
 
266 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182388  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3609  ABC transporter related  77.87 
 
 
255 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3794  ABC transporter related  77.47 
 
 
255 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.921656  normal  0.0592425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5466  ABC transporter related  77.47 
 
 
255 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501476  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5001  ABC transporter related  75.89 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585593  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  77.08 
 
 
279 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2595  histidine transport ATP-binding protein  77.08 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1408  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  76.28 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.106867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1442  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  77.08 
 
 
279 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0481  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  76.68 
 
 
279 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00989858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.94 
 
 
254 aa  380  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1238  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  76.68 
 
 
255 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.251071  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0208  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  76.68 
 
 
279 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1091  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  76.68 
 
 
279 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  71.94 
 
 
254 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  71.54 
 
 
254 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2855  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  71.94 
 
 
257 aa  364  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.717759  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  73.12 
 
 
254 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  73.12 
 
 
254 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  72.33 
 
 
254 aa  362  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  72.73 
 
 
254 aa  358  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26210  ATP-binding component of histidine transport  71.83 
 
 
255 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0271347  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2684  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
257 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2600  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
257 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3446  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
257 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377985  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  67.98 
 
 
257 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  71.54 
 
 
254 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2462  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
257 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.460847  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3323  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  70.75 
 
 
257 aa  355  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0414676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  71.94 
 
 
254 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02231  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
257 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.985627  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1350  ABC transporter related protein  69.17 
 
 
257 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02191  hypothetical protein  69.17 
 
 
257 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2456  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
257 aa  355  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  71.15 
 
 
254 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1346  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
257 aa  354  7.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  70.54 
 
 
260 aa  354  8.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
254 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  71.54 
 
 
254 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  67.7 
 
 
285 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2592  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
258 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2580  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
258 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.676694  normal  0.169811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2492  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
258 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.793796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2701  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
258 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2538  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 
257 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.75 
 
 
254 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  70.36 
 
 
254 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1431  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.38 
 
 
265 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000341956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0350  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.38 
 
 
265 aa  350  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00950632  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1541  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.38 
 
 
265 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.920327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1521  ABC transporter related  68.34 
 
 
258 aa  349  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1379  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  67.19 
 
 
257 aa  339  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.451284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1476  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.4 
 
 
257 aa  338  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2787  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.4 
 
 
257 aa  338  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0212634  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  65.74 
 
 
265 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  65.46 
 
 
265 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  63.71 
 
 
256 aa  328  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  64.66 
 
 
265 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2565  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  67.97 
 
 
257 aa  325  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  62.5 
 
 
268 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.53 
 
 
256 aa  325  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>