More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1592 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  80.88 
 
 		 266 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  80.48 
 
 		 266 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4412  ABC transporter related  82.66 
 
 		 258 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  75.3 
 
 		 254 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  77.33 
 
 		 258 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  74.7 
 
 		 252 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  63.16 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  63.67 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.86 
 
 		 249 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  62.45 
 
 		 257 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  60.82 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60.98 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  59.92 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  59.18 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.82 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  59.76 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  58.3 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  59.51 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.98 
 
 		 239 aa  289  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.94 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  59.36 
 
 		 263 aa  287  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  59.59 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.55 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.55 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.47 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  57.37 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  58.87 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.55 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  59.68 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.73 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.35 
 
 		 244 aa  285  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.07 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  60.98 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  61.22 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  60.41 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  58.26 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  59.18 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  60.41 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  58.23 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  60.57 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  58.3 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.72 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  59.27 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  56.15 
 
 		 258 aa  282  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  57.96 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 244 aa  281  9e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 240 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  62.01 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 240 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.71 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.94 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  55.87 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.86 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  60.57 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.87 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  54.07 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.83 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.96 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  57.03 
 
 		 252 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  55.82 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60.41 
 
 		 240 aa  278  7e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  57.14 
 
 		 240 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.78 
 
 		 246 aa  277  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.85 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.85 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  55.42 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.06 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  57.26 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.25 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  58.47 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>