More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1038 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  77.42 
 
 		 266 aa  400  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  79.12 
 
 		 254 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  77.02 
 
 		 266 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  77.33 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4412  ABC transporter related  76.26 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  70.61 
 
 		 252 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  62.86 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  60.82 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.45 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59.18 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59.18 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60.82 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  59.18 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.11 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  59.18 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  57.09 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.59 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.82 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 240 aa  285  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  285  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.78 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  58.06 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.55 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.55 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  58.94 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.92 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  58.37 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.33 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  57.96 
 
 		 245 aa  281  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.18 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.73 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  56.33 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.44 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  57.31 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.73 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  54.33 
 
 		 256 aa  278  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  57.55 
 
 		 266 aa  278  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.96 
 
 		 257 aa  278  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.69 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  57.25 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.18 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  54 
 
 		 246 aa  277  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  56.3 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.73 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  57.14 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.37 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.65 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.27 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.22 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  59.04 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56.08 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  53.25 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.02 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.55 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.07 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  55.87 
 
 		 251 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.9 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0118  ABC transporter related  56.33 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.71 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.33 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.55 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.51 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  56.49 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  57.03 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.8 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  56.85 
 
 		 245 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  56.5 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  55.17 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  57.49 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  58.13 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.47 
 
 		 242 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.03 
 
 		 243 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  59.39 
 
 		 243 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  58.3 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  54.66 
 
 		 258 aa  271  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.45 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.45 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.05 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  57.38 
 
 		 243 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>