More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4412 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4412  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  82.66 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  79.37 
 
 		 266 aa  410  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  78.97 
 
 		 266 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  75.79 
 
 		 254 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  76.26 
 
 		 258 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  70.97 
 
 		 252 aa  356  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  63.82 
 
 		 244 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  63.27 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.04 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  61.22 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  61.22 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.04 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.57 
 
 		 244 aa  291  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  60.73 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  58.06 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  58.57 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  60.89 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  59.18 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 267 aa  288  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  57.31 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  60.71 
 
 		 249 aa  288  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 		 253 aa  287  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  58.96 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  59.51 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  57.83 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.5 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  58.33 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  58.37 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  58.37 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.31 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  58.78 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  58.37 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  59.59 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  58.7 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  57.55 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  59.18 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.37 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  60.41 
 
 		 243 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 240 aa  285  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 240 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  58.43 
 
 		 271 aa  284  9e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  58.78 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  58.5 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.59 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  57.49 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  60.98 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  58.47 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.37 
 
 		 246 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  59.18 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.96 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  58.5 
 
 		 257 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  62.01 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  57.71 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  56.68 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.4 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.5 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56.37 
 
 		 256 aa  278  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  58.23 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.92 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.18 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.28 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.18 
 
 		 246 aa  278  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.06 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  56.45 
 
 		 252 aa  278  7e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  56.28 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60 
 
 		 240 aa  277  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 273 aa  277  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  56.91 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  56.5 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  56.63 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  58.78 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  56.5 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  55.12 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  55.92 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.96 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  56.2 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  57.2 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  56.5 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>