More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4158 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  75.3 
 
 		 253 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  75 
 
 		 266 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  79.12 
 
 		 258 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  74.6 
 
 		 266 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4412  ABC transporter related  75.79 
 
 		 258 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  71.84 
 
 		 252 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.57 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.22 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  57.55 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  61.94 
 
 		 246 aa  291  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.78 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  58.37 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  58.37 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.83 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.84 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58.2 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.55 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.96 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 		 251 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.96 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.94 
 
 		 257 aa  285  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  55.92 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  55.92 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.92 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.26 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  55.92 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.55 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.04 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.09 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.14 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  57.6 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  60.67 
 
 		 240 aa  282  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.18 
 
 		 267 aa  281  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.67 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.37 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  56.47 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.38 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  56.92 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 242 aa  279  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.68 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  59.18 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.14 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  56.33 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.82 
 
 		 245 aa  278  7e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 257 aa  278  7e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  57.14 
 
 		 256 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  56.73 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.17 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.33 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  54.47 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  55.82 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  56.73 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.92 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.55 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  55.69 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  57.55 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  54.98 
 
 		 246 aa  275  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  56.97 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  55.87 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 240 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  55.51 
 
 		 267 aa  274  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.78 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  55.78 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  58.61 
 
 		 261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  56.63 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  57.65 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.28 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.37 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  57.96 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  55.51 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  57.65 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.38 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  53.57 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  56.45 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.25 
 
 		 242 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  57.79 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  55.92 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.83 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.14 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.92 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  58.13 
 
 		 242 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2453  ABC transporter related  53.88 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.57 
 
 		 258 aa  271  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>