More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2453 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2453  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0640162  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0118  ABC transporter related  93.6 
 
 
250 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1390  ABC transporter related  66.67 
 
 
262 aa  341  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.836068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  57.71 
 
 
258 aa  292  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  56.56 
 
 
265 aa  278  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.24 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  53.88 
 
 
254 aa  271  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  55.95 
 
 
256 aa  271  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
273 aa  271  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  54.25 
 
 
253 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.15 
 
 
257 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
267 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  55.92 
 
 
266 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
260 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  54 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  56.1 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.18 
 
 
273 aa  269  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
251 aa  268  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  55.6 
 
 
264 aa  268  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  55.51 
 
 
266 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.07 
 
 
246 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.44 
 
 
267 aa  266  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  55.78 
 
 
255 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  56.5 
 
 
269 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54.18 
 
 
256 aa  265  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  54.22 
 
 
245 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.07 
 
 
244 aa  265  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  54.37 
 
 
262 aa  265  5.999999999999999e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  54.88 
 
 
244 aa  265  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  54.98 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  54.69 
 
 
240 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.88 
 
 
242 aa  264  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  53.41 
 
 
255 aa  264  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  54.88 
 
 
246 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.88 
 
 
246 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  54.76 
 
 
259 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  54 
 
 
254 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.24 
 
 
241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
240 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.24 
 
 
241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.82 
 
 
259 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.23 
 
 
244 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  55.1 
 
 
257 aa  262  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  51.84 
 
 
241 aa  262  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.1 
 
 
240 aa  262  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  54.36 
 
 
254 aa  262  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.73 
 
 
240 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  52.24 
 
 
241 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.2 
 
 
252 aa  261  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  52.03 
 
 
252 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.82 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.1 
 
 
252 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  51.84 
 
 
241 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.84 
 
 
241 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.84 
 
 
241 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.8 
 
 
263 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  54.66 
 
 
267 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.66 
 
 
246 aa  260  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.1 
 
 
258 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  54.88 
 
 
262 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 
244 aa  259  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  51.6 
 
 
247 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.56 
 
 
240 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.69 
 
 
257 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  53.47 
 
 
240 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
254 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.43 
 
 
241 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 
241 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  55.06 
 
 
243 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  54.4 
 
 
256 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.2 
 
 
268 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  55.19 
 
 
243 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.57 
 
 
254 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.23 
 
 
243 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  53.47 
 
 
262 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  53.47 
 
 
240 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.51 
 
 
240 aa  258  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  53.88 
 
 
260 aa  259  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  53.47 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  53.47 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  51.43 
 
 
241 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
262 aa  258  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 
244 aa  258  6e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
252 aa  258  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.36 
 
 
260 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.76 
 
 
268 aa  258  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.06 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  54.47 
 
 
251 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.06 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  51.82 
 
 
245 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 
254 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  55.65 
 
 
243 aa  257  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.41 
 
 
244 aa  257  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.24 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  54.36 
 
 
260 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>