More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3681 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  100 
 
 
267 aa  544  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  78.49 
 
 
263 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  76 
 
 
273 aa  391  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  74.1 
 
 
254 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  72.69 
 
 
260 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  73.6 
 
 
250 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  74 
 
 
250 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  74.1 
 
 
260 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  71.89 
 
 
258 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  71.2 
 
 
252 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  73.31 
 
 
254 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  68.8 
 
 
256 aa  363  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  69.35 
 
 
264 aa  360  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  68.8 
 
 
254 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  66.67 
 
 
259 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  67.6 
 
 
255 aa  347  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  67.73 
 
 
254 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  67.2 
 
 
267 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  66.93 
 
 
259 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  65.2 
 
 
261 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  66.67 
 
 
253 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  66.8 
 
 
254 aa  341  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  67.06 
 
 
276 aa  338  5e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  64.94 
 
 
256 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  64.8 
 
 
254 aa  334  9e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.4 
 
 
254 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  63.35 
 
 
256 aa  332  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  60.92 
 
 
268 aa  328  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
254 aa  328  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  63.75 
 
 
263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.8 
 
 
260 aa  325  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  64.75 
 
 
279 aa  322  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  62.25 
 
 
256 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  61.35 
 
 
263 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  59.45 
 
 
598 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  63.14 
 
 
264 aa  321  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  62.85 
 
 
264 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  66.27 
 
 
262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.24 
 
 
595 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.04 
 
 
592 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  62 
 
 
254 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  60 
 
 
274 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  60.87 
 
 
261 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  63.1 
 
 
256 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.6 
 
 
602 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.47 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  60.4 
 
 
252 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.52 
 
 
594 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  60.16 
 
 
267 aa  309  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.6 
 
 
240 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  61.66 
 
 
263 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.04 
 
 
594 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  57.14 
 
 
636 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  57.14 
 
 
636 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.14 
 
 
636 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.14 
 
 
636 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.64 
 
 
619 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.14 
 
 
636 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  62.4 
 
 
243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4597  putative ATP-binding component of ABC transporter  64.8 
 
 
265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.838363  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.99 
 
 
268 aa  304  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.63 
 
 
636 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.4 
 
 
239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  60.56 
 
 
257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  60.64 
 
 
248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.6 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.44 
 
 
595 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.44 
 
 
597 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  59.43 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  58.4 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.29 
 
 
244 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  58.4 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  55.51 
 
 
288 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  60 
 
 
251 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  59.44 
 
 
597 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.44 
 
 
597 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  55.06 
 
 
289 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  56.59 
 
 
272 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  58.8 
 
 
274 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  61.75 
 
 
253 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.23 
 
 
636 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  60.8 
 
 
243 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.96 
 
 
246 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54.68 
 
 
289 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  57.83 
 
 
254 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.43 
 
 
249 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  60.4 
 
 
243 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.6 
 
 
240 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.72 
 
 
252 aa  299  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  59.84 
 
 
249 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  61.04 
 
 
243 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  58 
 
 
275 aa  299  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  60.32 
 
 
263 aa  298  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60.96 
 
 
244 aa  298  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.75 
 
 
240 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  58.4 
 
 
242 aa  297  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.77 
 
 
246 aa  296  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  61.2 
 
 
253 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>