More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5107 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  100 
 
 
288 aa  594  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  89 
 
 
289 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  87.2 
 
 
289 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  64.37 
 
 
263 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  58.98 
 
 
263 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  57.81 
 
 
263 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.98 
 
 
263 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
267 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  58.27 
 
 
256 aa  301  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.47 
 
 
258 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.18 
 
 
259 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  57.36 
 
 
260 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  57.36 
 
 
260 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  55.02 
 
 
280 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.8 
 
 
254 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58 
 
 
240 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.95 
 
 
256 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  59.24 
 
 
250 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  58 
 
 
240 aa  289  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.6 
 
 
240 aa  288  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
273 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58.82 
 
 
250 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  55.82 
 
 
260 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 
244 aa  285  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.66 
 
 
244 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 
244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  54.76 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.66 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  54.62 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 
244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 
244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 
244 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
240 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
254 aa  281  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.6 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.76 
 
 
255 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  56.28 
 
 
261 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  54.18 
 
 
259 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 
282 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  53.2 
 
 
256 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.13 
 
 
249 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.1 
 
 
240 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 
244 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.22 
 
 
263 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 
244 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.4 
 
 
244 aa  279  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 
253 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.69 
 
 
246 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  55.91 
 
 
269 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.28 
 
 
240 aa  278  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
254 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  55.69 
 
 
241 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  53.56 
 
 
267 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56 
 
 
240 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  56.28 
 
 
254 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.06 
 
 
244 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.69 
 
 
244 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  53.82 
 
 
260 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.44 
 
 
257 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  56.68 
 
 
255 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  50.38 
 
 
252 aa  275  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.8 
 
 
247 aa  275  7e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  52.8 
 
 
242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  57.09 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  54.8 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  51.56 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.6 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  53.97 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  51.76 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.53 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  54.8 
 
 
252 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.47 
 
 
262 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  52.63 
 
 
264 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.5 
 
 
248 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.22 
 
 
242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  52.4 
 
 
242 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.45 
 
 
278 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.87 
 
 
252 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.24 
 
 
263 aa  271  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  54.41 
 
 
252 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.54 
 
 
263 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  55.73 
 
 
266 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  54.94 
 
 
247 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  54.84 
 
 
254 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  53.54 
 
 
263 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  53.23 
 
 
258 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.4 
 
 
239 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  53.44 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  51.52 
 
 
282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>