More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6448 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  87.07 
 
 		 263 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  79.77 
 
 		 263 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  57.81 
 
 		 288 aa  305  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  57.42 
 
 		 289 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.42 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  55.47 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  52.12 
 
 		 256 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  54 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  54.37 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.55 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  50 
 
 		 280 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  54.76 
 
 		 259 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  55.38 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.97 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.56 
 
 		 276 aa  268  5e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  51.19 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  55.73 
 
 		 257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  53.08 
 
 		 273 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.36 
 
 		 263 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.04 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.8 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.37 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  52.96 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 267 aa  265  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.41 
 
 		 263 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.25 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.33 
 
 		 268 aa  264  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.23 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  50.6 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  51.78 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  55.28 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.24 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.66 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  53.44 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  55.28 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.78 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  51.87 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  51.45 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.41 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.8 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 		 273 aa  258  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 		 240 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  51.2 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.44 
 
 		 243 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 		 240 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  51.81 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.66 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 240 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  52.42 
 
 		 246 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.44 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.59 
 
 		 250 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.85 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.82 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  53.25 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  52.82 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  53.33 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  52.02 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  50.79 
 
 		 256 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 		 240 aa  255  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.76 
 
 		 268 aa  255  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  52.96 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  51.61 
 
 		 260 aa  255  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.03 
 
 		 243 aa  255  7e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  52 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  51.18 
 
 		 261 aa  254  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  52.02 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  53.33 
 
 		 250 aa  254  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  52.23 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  50.79 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7509  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  51.57 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  52.34 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>