More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6087 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  58.43 
 
 
263 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  55.02 
 
 
288 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  55.81 
 
 
289 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  55.43 
 
 
289 aa  298  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  50 
 
 
263 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  51.94 
 
 
263 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.22 
 
 
267 aa  278  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.35 
 
 
267 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  52.19 
 
 
242 aa  275  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  51.79 
 
 
242 aa  275  9e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  52.17 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  53.75 
 
 
265 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.38 
 
 
263 aa  272  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  52.82 
 
 
240 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
240 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
240 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.02 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.02 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.02 
 
 
273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
240 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  52.02 
 
 
240 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  52.02 
 
 
240 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
240 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  56.02 
 
 
255 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
240 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  52.78 
 
 
259 aa  265  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  52.78 
 
 
259 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  55.6 
 
 
267 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.38 
 
 
260 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.37 
 
 
258 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  52.55 
 
 
255 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  52.34 
 
 
256 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  52.94 
 
 
259 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  52.73 
 
 
257 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  53.17 
 
 
256 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  53.44 
 
 
258 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  52 
 
 
261 aa  262  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.65 
 
 
250 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.78 
 
 
268 aa  262  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  50.4 
 
 
263 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  53.39 
 
 
264 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  48.18 
 
 
240 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  52.78 
 
 
263 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  52.42 
 
 
256 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  52.4 
 
 
255 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
253 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  54.44 
 
 
261 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  51.79 
 
 
260 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
244 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  52.21 
 
 
254 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.02 
 
 
244 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
244 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
244 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.38 
 
 
265 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  50 
 
 
282 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
244 aa  258  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  50.4 
 
 
244 aa  258  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1711  ABC transporter related  51 
 
 
259 aa  258  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  52.42 
 
 
250 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  51.01 
 
 
254 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.38 
 
 
300 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  50.59 
 
 
259 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0870  ABC transporter related  50.81 
 
 
269 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  51.76 
 
 
264 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.02 
 
 
250 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.42 
 
 
241 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.42 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
244 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.42 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3706  ABC transporter related  52 
 
 
273 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
247 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  52.61 
 
 
261 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0371  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 
265 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  52.63 
 
 
246 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  52.44 
 
 
252 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  49.19 
 
 
240 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2015  ABC transporter related  51.21 
 
 
265 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  54.07 
 
 
245 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
598 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  52.82 
 
 
252 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
260 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  46.88 
 
 
253 aa  255  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.73 
 
 
267 aa  255  7e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
244 aa  254  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
244 aa  254  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 
244 aa  254  9e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  51 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  49.8 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.78 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  50.79 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  49.64 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>