More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2015 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0371  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2015  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0870  ABC transporter related  97.74 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3706  ABC transporter related  80.15 
 
 		 273 aa  431  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1711  ABC transporter related  78.88 
 
 		 259 aa  421  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2221  putative amino acid ABC transporter  81.35 
 
 		 259 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1134  ABC transporter related  77.2 
 
 		 260 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 		 257 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  60.47 
 
 		 256 aa  309  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  61.96 
 
 		 260 aa  307  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  58.96 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  57.75 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  61.18 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  58.53 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  58.57 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  58.37 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  57.6 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  59.27 
 
 		 259 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  58.37 
 
 		 257 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  60.64 
 
 		 285 aa  301  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  57.59 
 
 		 261 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  59.68 
 
 		 259 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  58.8 
 
 		 264 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  59.27 
 
 		 259 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  60 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  59.27 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  59.27 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 255 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 255 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 255 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  59.18 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 255 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0283  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  59.27 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  57.71 
 
 		 263 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4927  ABC transporter related  58.75 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000746315 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  59.76 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  58.87 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  58 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  58 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  58 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  59.44 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  58 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0301  ABC transporter related  58.75 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  0.0971272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.87 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0306  ABC transporter related  58.75 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0328197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  57.2 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  59.35 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  59.35 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.94 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  58.47 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.71 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  56.75 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  57.43 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  58.94 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  58.94 
 
 		 266 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.05 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  58.94 
 
 		 266 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  55.95 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  56.4 
 
 		 263 aa  291  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  55.65 
 
 		 263 aa  288  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 		 254 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  57.77 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  57.83 
 
 		 254 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  56.3 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  56.3 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  55.04 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  55.08 
 
 		 265 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1957  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, ATP-binding component  58.1 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5620  ABC transporter related  56.69 
 
 		 263 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33769  normal  0.48153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  56.69 
 
 		 263 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  55.08 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5012  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.45 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01549  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  58.27 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  56.3 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  56.3 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  54.55 
 
 		 275 aa  278  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  56.3 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  57.83 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6396  ABC transporter related  59.22 
 
 		 259 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784056  normal  0.338935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0176  ABC transporter related  58.87 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  54.69 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5070  ABC transporter related  58.4 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2456  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  58.8 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2462  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  58.8 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.460847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2684  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  58.8 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2600  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  58.8 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3446  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  58.8 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4530  ABC transporter related  58.43 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0252344  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  55.24 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1346  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  58.4 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>