More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0968 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4549  ABC transporter related  81.5 
 
 		 255 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  70.52 
 
 		 265 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5539  ABC transporter related  72.66 
 
 		 256 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5261  ABC transporter related  72.66 
 
 		 256 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  69.32 
 
 		 261 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.13 
 
 		 263 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  54.4 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54 
 
 		 289 aa  284  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  56.5 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  56.5 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  53.2 
 
 		 288 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.5 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.24 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  56.05 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 244 aa  274  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.1 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  53.85 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.82 
 
 		 263 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.38 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.4 
 
 		 254 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.72 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  51.61 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.42 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.02 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  54.25 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  51.59 
 
 		 265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  55.88 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  54.22 
 
 		 243 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  53.23 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.47 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.76 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  51.19 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  53.66 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  52.03 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  52.8 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.44 
 
 		 246 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  53.85 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 240 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.88 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 267 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  53.2 
 
 		 263 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  51.59 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  51.81 
 
 		 254 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  51.21 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  53.04 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  51.42 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  53.23 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.85 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.44 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1711  ABC transporter related  51.59 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  53.01 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.23 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  52.82 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.23 
 
 		 244 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51.79 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  52.23 
 
 		 268 aa  261  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  52.36 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 		 268 aa  261  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.6 
 
 		 263 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  52.19 
 
 		 245 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  52.42 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  51.03 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.8 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.94 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  51.21 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.04 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  51.79 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.29 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>