More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3670 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  80.17 
 
 		 261 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  80 
 
 		 246 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  74.69 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  72.06 
 
 		 252 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  72.73 
 
 		 252 aa  358  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  70.46 
 
 		 241 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  68.33 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  69.62 
 
 		 241 aa  338  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  69.62 
 
 		 241 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  66.94 
 
 		 243 aa  329  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  65.29 
 
 		 244 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  65.29 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  64.73 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  63.33 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  62.66 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  61.83 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  63.37 
 
 		 249 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  61.94 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  62.96 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  62.96 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.48 
 
 		 245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  61.48 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  61 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  61.07 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  62.3 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  60.17 
 
 		 243 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  59.75 
 
 		 247 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 247 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  62.5 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  60.87 
 
 		 506 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  58.68 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  58.82 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  59.09 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  56.13 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.61 
 
 		 248 aa  281  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  57.94 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  58.65 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.65 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  56.38 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  55.51 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.05 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  56.85 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  55.51 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  54.25 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  57.68 
 
 		 257 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  56.07 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  56.07 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.43 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.25 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.72 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  56.07 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.58 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.58 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.97 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  56.79 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.83 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  54.85 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  56.07 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.04 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  53.41 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  54.51 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  54.62 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  56.61 
 
 		 254 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55.42 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  57.2 
 
 		 245 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  56.25 
 
 		 242 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  52.92 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.42 
 
 		 244 aa  264  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  55.92 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  58.23 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  53.75 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.63 
 
 		 256 aa  262  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  55 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.12 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  54.1 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  53.06 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  57.02 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 		 241 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  261  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  53.97 
 
 		 257 aa  261  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  55 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  53.39 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  53.33 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.33 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>