More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0020 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  99.59 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  94.29 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  88.57 
 
 		 245 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  85.89 
 
 		 248 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  73.77 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  72.65 
 
 		 244 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  72.13 
 
 		 243 aa  361  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.24 
 
 		 244 aa  358  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  71.84 
 
 		 245 aa  357  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  67.77 
 
 		 241 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  66.12 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  66.8 
 
 		 241 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  65.71 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  65.71 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  65.29 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  63.41 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  64.61 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  61.22 
 
 		 242 aa  314  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  63.11 
 
 		 261 aa  310  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  62.3 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  62.75 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  62.45 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  61.48 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  62.35 
 
 		 247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  62.35 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  61.94 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.94 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  60.08 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  60.73 
 
 		 247 aa  295  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  61.32 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  62.55 
 
 		 506 aa  288  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  60.17 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  59.26 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  60.34 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  57.02 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  60.43 
 
 		 239 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.38 
 
 		 244 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.74 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  57.08 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  56.73 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  52.46 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.74 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  57.49 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.83 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  56.15 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.97 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  55.19 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  55.37 
 
 		 246 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  52.19 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  53.78 
 
 		 265 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.51 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  51.65 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  54.39 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  52.87 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  53.69 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.81 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  53.09 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.48 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.72 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  56.73 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  57.08 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  53.97 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  53.09 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.07 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  56.38 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  51.65 
 
 		 239 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.66 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.65 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  50.62 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  52.07 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  54.47 
 
 		 252 aa  254  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  52.48 
 
 		 242 aa  255  6e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  52.92 
 
 		 282 aa  254  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.4 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  54.84 
 
 		 275 aa  253  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  54.4 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  54 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  53.31 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.56 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  53.28 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  54.1 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  53.28 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.87 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.87 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.59 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  52.89 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  52.26 
 
 		 247 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.28 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  52.28 
 
 		 242 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  53.09 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.13 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>