More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0295 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  100 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  97.95 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  95.04 
 
 		 245 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  86.89 
 
 		 244 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  86.31 
 
 		 243 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  75.1 
 
 		 245 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  72.65 
 
 		 245 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  72.47 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  72.65 
 
 		 245 aa  361  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  72.24 
 
 		 245 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  70.49 
 
 		 249 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  70.08 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  70.08 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  68.62 
 
 		 241 aa  338  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  66.39 
 
 		 242 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  67.36 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  66.12 
 
 		 246 aa  331  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  65.29 
 
 		 255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  66.11 
 
 		 241 aa  324  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  63.9 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  63.9 
 
 		 243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  63.49 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  63.9 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  63.9 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  64.05 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  63.07 
 
 		 243 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  64.58 
 
 		 252 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 		 248 aa  311  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  63.07 
 
 		 248 aa  311  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  63.07 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  62.5 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  63.48 
 
 		 506 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  60.67 
 
 		 243 aa  296  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.09 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  60.94 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.26 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  58.51 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.02 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  60.52 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  59 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  58.02 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  59 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 247 aa  281  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.07 
 
 		 246 aa  279  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.07 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  57.74 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  57.08 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.9 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.7 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  57.56 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  55.6 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.73 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.07 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.27 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  57.51 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.88 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.31 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.77 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.56 
 
 		 239 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  56.4 
 
 		 265 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  54.17 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.72 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.88 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  56.49 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  54.81 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 240 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55.42 
 
 		 247 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 263 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  51.05 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  53.23 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  52.3 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  54.66 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  52.97 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.85 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.36 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  54.17 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  53.09 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  53.09 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  52.02 
 
 		 275 aa  261  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.28 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  56.07 
 
 		 248 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  53.91 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.7 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  51.25 
 
 		 246 aa  260  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  51.46 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  51.85 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  55.93 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>