More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1154 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
246 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  83.4 
 
 
242 aa  407  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  79.25 
 
 
242 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.55 
 
 
240 aa  347  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  72.38 
 
 
240 aa  347  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.97 
 
 
240 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.97 
 
 
240 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.97 
 
 
240 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.97 
 
 
240 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.97 
 
 
240 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.55 
 
 
240 aa  345  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  70.29 
 
 
240 aa  340  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 
242 aa  339  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.55 
 
 
240 aa  338  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  71.13 
 
 
240 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.04 
 
 
240 aa  334  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 
242 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 
242 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 
242 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2355  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 
242 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2096  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.87 
 
 
240 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1485  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.87 
 
 
240 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1124  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 
242 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1404  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 
242 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.595222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3270  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 
242 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3156  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 
242 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.805014  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2389  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  69.58 
 
 
242 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  68.62 
 
 
240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  68.62 
 
 
240 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  68.2 
 
 
240 aa  325  5e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  60.42 
 
 
243 aa  298  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.09 
 
 
244 aa  291  8e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.47 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.47 
 
 
243 aa  285  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.47 
 
 
243 aa  284  9e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.16 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59 
 
 
239 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.9 
 
 
246 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.58 
 
 
249 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.08 
 
 
244 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
240 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.25 
 
 
244 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
242 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.07 
 
 
243 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  55 
 
 
251 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.49 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.72 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.72 
 
 
242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.83 
 
 
246 aa  271  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  56.49 
 
 
245 aa  271  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.81 
 
 
240 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.65 
 
 
240 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  57.14 
 
 
258 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  51.88 
 
 
240 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.37 
 
 
243 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  55.93 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.92 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  56.07 
 
 
247 aa  268  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  52.72 
 
 
265 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  54.25 
 
 
252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
245 aa  268  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.42 
 
 
242 aa  268  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  57.63 
 
 
242 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.39 
 
 
242 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  56.57 
 
 
254 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  55.65 
 
 
255 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 
240 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 
251 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  54.73 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  57.03 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54 
 
 
263 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.78 
 
 
248 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.88 
 
 
246 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  51.84 
 
 
248 aa  265  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
252 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  56.54 
 
 
252 aa  264  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  54.29 
 
 
253 aa  264  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  51.64 
 
 
258 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  56.49 
 
 
243 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  51.64 
 
 
258 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  52.46 
 
 
253 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  55 
 
 
243 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.78 
 
 
248 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
253 aa  262  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  52.94 
 
 
256 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  56.96 
 
 
251 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.33 
 
 
255 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.97 
 
 
240 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  53.14 
 
 
253 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>