More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3975 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  72.2 
 
 		 262 aa  358  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  72.38 
 
 		 246 aa  353  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  70.12 
 
 		 244 aa  344  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  66.11 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  65 
 
 		 243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  65.83 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  63.6 
 
 		 242 aa  307  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  62.76 
 
 		 257 aa  297  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  63.18 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  61.86 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  58.85 
 
 		 246 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  58.82 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  59.24 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  55.88 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  56.36 
 
 		 242 aa  271  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  55.04 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  57.51 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  56.3 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  56.3 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.88 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  56.3 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  57.08 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  56.54 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  54.2 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.36 
 
 		 244 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  57.81 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  55.83 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  56.49 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  53.78 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  54.62 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.13 
 
 		 243 aa  262  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  55.42 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  55.42 
 
 		 245 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.58 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  52.94 
 
 		 243 aa  261  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  58.37 
 
 		 243 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.4 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.1 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  55.14 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.59 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  54.43 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  55.31 
 
 		 506 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  51.26 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 267 aa  255  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.53 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  55.51 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  54.17 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  57.53 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 		 240 aa  251  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.95 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.9 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  58.99 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  53.14 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  53.39 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.33 
 
 		 251 aa  247  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.44 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  50.42 
 
 		 240 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.9 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.9 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.9 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  52.05 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  51 
 
 		 263 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  53.14 
 
 		 243 aa  244  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.16 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>