More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8009 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  89.23 
 
 		 260 aa  477  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  75.89 
 
 		 259 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  79.58 
 
 		 250 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  68.46 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  60.33 
 
 		 256 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  62.92 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  60.74 
 
 		 269 aa  301  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.35 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  58.59 
 
 		 336 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.43 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.67 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  57.26 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 247 aa  291  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.17 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.67 
 
 		 246 aa  288  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  58 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  56.85 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.08 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  57.68 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.68 
 
 		 246 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.83 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.26 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  58.2 
 
 		 286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.68 
 
 		 249 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  57.85 
 
 		 272 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  55.83 
 
 		 246 aa  281  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  58.75 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.59 
 
 		 269 aa  281  7.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.6 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.67 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  56.59 
 
 		 269 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 244 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  58.16 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.43 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.66 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.78 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  55.19 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  57.26 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.33 
 
 		 278 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56.43 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.17 
 
 		 246 aa  278  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  54.83 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  54.81 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 249 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.36 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.33 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.42 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  54.39 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.47 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.13 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  52.69 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  55.69 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  55.19 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  51.21 
 
 		 252 aa  275  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  56.38 
 
 		 269 aa  274  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  59.49 
 
 		 241 aa  274  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  54.36 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  55.19 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  56.25 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  53.97 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  55.82 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  53.01 
 
 		 259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  56.45 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  53.97 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.25 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  55.74 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  54.58 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  54.69 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  56.85 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.96 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.39 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.96 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  54.1 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>