More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1599 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  76.02 
 
 
262 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  72.38 
 
 
243 aa  353  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  71.6 
 
 
244 aa  352  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  71.55 
 
 
242 aa  351  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  67.63 
 
 
243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  65.42 
 
 
242 aa  324  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  67.66 
 
 
243 aa  321  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  67.08 
 
 
257 aa  319  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  67.78 
 
 
242 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  63.14 
 
 
239 aa  305  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  59.41 
 
 
245 aa  285  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  60.08 
 
 
243 aa  284  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  57.92 
 
 
242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  56.9 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  59.09 
 
 
255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  59 
 
 
244 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.56 
 
 
244 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.49 
 
 
244 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 
247 aa  278  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  56.49 
 
 
243 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  58.09 
 
 
246 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  58.16 
 
 
249 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  57.32 
 
 
244 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  57.74 
 
 
249 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  57.74 
 
 
249 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  58.23 
 
 
241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  57.92 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.92 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  55.23 
 
 
247 aa  271  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  57.02 
 
 
506 aa  271  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  55.23 
 
 
243 aa  271  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  57.14 
 
 
241 aa  271  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  57.98 
 
 
247 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.78 
 
 
244 aa  269  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  57.81 
 
 
241 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  57.56 
 
 
242 aa  268  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  57.5 
 
 
242 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  56.96 
 
 
241 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  56.97 
 
 
252 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  56.61 
 
 
245 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.85 
 
 
242 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  54.81 
 
 
247 aa  267  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  55.08 
 
 
243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  58.26 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.3 
 
 
240 aa  265  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
242 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  56.9 
 
 
243 aa  264  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  56.02 
 
 
251 aa  264  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  55.46 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  54.66 
 
 
242 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.01 
 
 
246 aa  262  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  53.69 
 
 
256 aa  261  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.07 
 
 
248 aa  262  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  55.37 
 
 
245 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  54.96 
 
 
245 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.36 
 
 
243 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  55.1 
 
 
248 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.87 
 
 
246 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  55.87 
 
 
252 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 
240 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.25 
 
 
249 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 
240 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
240 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  56.68 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.27 
 
 
242 aa  258  6e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 
240 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  52.08 
 
 
240 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  53.47 
 
 
251 aa  257  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  56.3 
 
 
244 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
240 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  53.39 
 
 
265 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.01 
 
 
266 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.42 
 
 
242 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  55.06 
 
 
254 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.25 
 
 
243 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  54.78 
 
 
247 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  55.51 
 
 
240 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  52.12 
 
 
246 aa  256  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
254 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  52.61 
 
 
266 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  55.23 
 
 
243 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 
246 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  51.67 
 
 
243 aa  255  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  53.41 
 
 
252 aa  255  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.78 
 
 
240 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  55.79 
 
 
252 aa  255  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.17 
 
 
239 aa  255  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>