More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4926 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  71.6 
 
 		 246 aa  352  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  70.12 
 
 		 243 aa  344  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  68.6 
 
 		 262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  68.85 
 
 		 242 aa  338  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  69.92 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  69.96 
 
 		 243 aa  337  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  67.9 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  67.62 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  66.8 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  62.76 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  64.14 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  61.09 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  58.68 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  58.82 
 
 		 242 aa  291  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  59.34 
 
 		 249 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  59.75 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  61 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  58.92 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  58.92 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  59.58 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 244 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  60.17 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.72 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  57.72 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  59.75 
 
 		 245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  58.51 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  56.85 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  59.75 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  57.68 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 		 247 aa  281  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  56.02 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  58.58 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  58.2 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  56.9 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.02 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  55.6 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.14 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  57.14 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  57.94 
 
 		 506 aa  272  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 247 aa  271  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.56 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.09 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  55.04 
 
 		 252 aa  268  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.37 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.2 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  56.3 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.13 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.31 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.75 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.72 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  53.72 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.55 
 
 		 239 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.43 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.25 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  53.25 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  52.65 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.92 
 
 		 255 aa  258  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  55.23 
 
 		 243 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.72 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  52.48 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.67 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  56.2 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.56 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  53.28 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  52.94 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.4 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 255 aa  252  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.2 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  51.45 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.94 
 
 		 252 aa  252  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  53.66 
 
 		 259 aa  252  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  54.17 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  51.79 
 
 		 263 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.56 
 
 		 278 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  52.65 
 
 		 243 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  53.31 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.31 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 242 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  52.7 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 273 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  51 
 
 		 259 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  49.79 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  52.21 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.82 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  54.58 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  53.31 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  57.47 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>