More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3973 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  70.37 
 
 		 243 aa  345  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  69.96 
 
 		 244 aa  337  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  67.22 
 
 		 262 aa  334  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  67.63 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  64.88 
 
 		 242 aa  318  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  65.98 
 
 		 257 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  65.83 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  63.33 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  66.25 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  61.41 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  65.27 
 
 		 239 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  60.25 
 
 		 241 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  60.92 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  60.42 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  60.25 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  61.92 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  61.92 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  60.67 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  59.83 
 
 		 249 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  59.83 
 
 		 249 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 244 aa  297  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  61.09 
 
 		 244 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  60.67 
 
 		 244 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  59.66 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  60.08 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  60.91 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  58.26 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  59.18 
 
 		 248 aa  291  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  59.24 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  58.09 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  59.07 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  58.82 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  59.26 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  58.85 
 
 		 245 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  58.85 
 
 		 245 aa  284  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  58.23 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  58.26 
 
 		 506 aa  275  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  56.9 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.04 
 
 		 249 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.04 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.12 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.27 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.78 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  56.78 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  56.72 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  56.43 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  54.4 
 
 		 255 aa  264  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  55.56 
 
 		 266 aa  264  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.59 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  55.14 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.89 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.93 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  56.57 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  54.24 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.43 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  54.44 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.33 
 
 		 239 aa  261  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  52.52 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.88 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  51.69 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  51.19 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  54.58 
 
 		 268 aa  259  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.06 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  53.78 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  55.1 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.39 
 
 		 254 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  55.04 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.39 
 
 		 254 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  54.47 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.36 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.3 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.14 
 
 		 247 aa  258  8e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  53.81 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  55.04 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  53.56 
 
 		 243 aa  257  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.24 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.44 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  52.24 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.51 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  53.31 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  52.89 
 
 		 242 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  52.89 
 
 		 242 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.24 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4412  ABC transporter related  57.44 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  52.54 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>