More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0880 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  92.18 
 
 
243 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  92.15 
 
 
247 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  90.91 
 
 
247 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  88.84 
 
 
247 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  87.6 
 
 
248 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  87.6 
 
 
248 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  87.39 
 
 
506 aa  417  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  73.03 
 
 
242 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  69.42 
 
 
242 aa  359  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  64.32 
 
 
245 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  63.37 
 
 
243 aa  321  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 
244 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  63.9 
 
 
244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  63.9 
 
 
244 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  63.56 
 
 
248 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  62.45 
 
 
245 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  62.66 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  62.24 
 
 
246 aa  311  6.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  62.75 
 
 
245 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  63.97 
 
 
245 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  62.35 
 
 
245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  63.87 
 
 
241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  61 
 
 
261 aa  306  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  61.16 
 
 
252 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  59.92 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  62.61 
 
 
241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  59.5 
 
 
249 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  59.5 
 
 
249 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  63.45 
 
 
241 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  61 
 
 
252 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  61 
 
 
252 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  56.07 
 
 
262 aa  292  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  57.98 
 
 
243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  56.85 
 
 
244 aa  285  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  56.25 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  58.44 
 
 
243 aa  281  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
242 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  57.74 
 
 
240 aa  279  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.74 
 
 
240 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.93 
 
 
248 aa  275  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  55.83 
 
 
240 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  274  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.39 
 
 
242 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  54.8 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.39 
 
 
239 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.22 
 
 
263 aa  271  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  55.23 
 
 
246 aa  271  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.77 
 
 
249 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
254 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.24 
 
 
248 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.17 
 
 
244 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  53.94 
 
 
247 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  57.14 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.94 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  52.7 
 
 
242 aa  268  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  52.7 
 
 
242 aa  268  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
253 aa  268  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.08 
 
 
246 aa  268  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  54.85 
 
 
240 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.04 
 
 
242 aa  267  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  55.93 
 
 
248 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  56.45 
 
 
254 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  50.85 
 
 
265 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.39 
 
 
263 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  55.42 
 
 
239 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  51.24 
 
 
248 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  53.72 
 
 
243 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.62 
 
 
242 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.72 
 
 
240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.81 
 
 
240 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  52.92 
 
 
247 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  55.08 
 
 
251 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  52.72 
 
 
240 aa  265  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.14 
 
 
243 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  53.14 
 
 
243 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  53.36 
 
 
242 aa  264  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.11 
 
 
244 aa  264  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
253 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 
254 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 
242 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  52.3 
 
 
246 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  53.78 
 
 
242 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.75 
 
 
244 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  52.3 
 
 
240 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.56 
 
 
240 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  53.53 
 
 
247 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.14 
 
 
244 aa  263  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.72 
 
 
243 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
244 aa  262  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  52.28 
 
 
246 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  52.44 
 
 
259 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
269 aa  262  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
240 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.66 
 
 
252 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  53.14 
 
 
240 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  50.62 
 
 
256 aa  261  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
240 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.25 
 
 
247 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.72 
 
 
240 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>