More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3446 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  100 
 
 
506 aa  1045    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3325  aminotransferase class V  99.64 
 
 
441 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  98.55 
 
 
451 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  88.41 
 
 
413 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3309  aminotransferase class V  88.41 
 
 
414 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  89.13 
 
 
414 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  87.32 
 
 
414 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  86.23 
 
 
414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  94.76 
 
 
248 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  94.76 
 
 
248 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  72.1 
 
 
409 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  90.87 
 
 
247 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  88.7 
 
 
247 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  88.7 
 
 
247 aa  422  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  87.39 
 
 
243 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  86.46 
 
 
243 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  69.34 
 
 
426 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  67.88 
 
 
406 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  69.71 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  68.12 
 
 
410 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  63.57 
 
 
455 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  61.85 
 
 
436 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  60.36 
 
 
412 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  61.48 
 
 
415 aa  352  7e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  61.74 
 
 
411 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  70.87 
 
 
242 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  71.3 
 
 
242 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  58.7 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  64.78 
 
 
243 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  65.22 
 
 
244 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  64.35 
 
 
245 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.91 
 
 
244 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  63.48 
 
 
244 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  65.24 
 
 
245 aa  299  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  63.95 
 
 
245 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  60.87 
 
 
255 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  62.34 
 
 
252 aa  293  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  62.29 
 
 
248 aa  293  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  62.98 
 
 
245 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  60.26 
 
 
246 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  60.43 
 
 
261 aa  289  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  61.21 
 
 
249 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  62.55 
 
 
245 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  60.78 
 
 
249 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  60.78 
 
 
249 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  60.87 
 
 
241 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  57.58 
 
 
262 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  62.61 
 
 
241 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  57.39 
 
 
243 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  58.26 
 
 
243 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.9 
 
 
242 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  56.02 
 
 
247 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.6 
 
 
242 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.28 
 
 
248 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  57.94 
 
 
244 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  57.02 
 
 
246 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  59.39 
 
 
243 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.06 
 
 
248 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.84 
 
 
239 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.22 
 
 
249 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.1 
 
 
253 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.88 
 
 
248 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  58.95 
 
 
252 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  56.79 
 
 
254 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  56.79 
 
 
254 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  56.28 
 
 
248 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.5 
 
 
242 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.39 
 
 
243 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.46 
 
 
244 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.39 
 
 
240 aa  263  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  54.98 
 
 
255 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  57.27 
 
 
251 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  58.7 
 
 
252 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.19 
 
 
240 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.95 
 
 
243 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  55.97 
 
 
248 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  53.45 
 
 
256 aa  261  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.46 
 
 
242 aa  260  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.51 
 
 
240 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.26 
 
 
240 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  53.95 
 
 
243 aa  259  9e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.04 
 
 
263 aa  259  9e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.9 
 
 
267 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  55.9 
 
 
256 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.31 
 
 
240 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.31 
 
 
240 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  56.58 
 
 
252 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.71 
 
 
244 aa  259  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  56.14 
 
 
241 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.22 
 
 
244 aa  258  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  51.72 
 
 
265 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  54.35 
 
 
242 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.7 
 
 
240 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  54.15 
 
 
246 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 
240 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 
240 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  55.31 
 
 
243 aa  257  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.21 
 
 
267 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  54.31 
 
 
240 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>