More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0227 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  89.92 
 
 		 245 aa  447  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  86.69 
 
 		 245 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  86.29 
 
 		 245 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  85.89 
 
 		 245 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  72.47 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 244 aa  362  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  71.37 
 
 		 245 aa  358  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  70.16 
 
 		 243 aa  355  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  70.04 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  66.12 
 
 		 241 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  65.32 
 
 		 249 aa  328  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  67.35 
 
 		 241 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  64.92 
 
 		 249 aa  327  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  64.92 
 
 		 249 aa  327  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  64.11 
 
 		 243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  63.97 
 
 		 242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  62.1 
 
 		 242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  63.56 
 
 		 261 aa  318  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  64.08 
 
 		 241 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  63.56 
 
 		 243 aa  316  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  62.6 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  61.54 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  62.9 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  61.94 
 
 		 255 aa  311  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  62.9 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  62.2 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  62.1 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.1 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  61.38 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  61.69 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  62.29 
 
 		 506 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  59.18 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  60.16 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  58.37 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.91 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  58.2 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.29 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  55.95 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.47 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.51 
 
 		 240 aa  269  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  56.38 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  53.04 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.92 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  58 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  53.85 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  54.55 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  55.97 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.88 
 
 		 244 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.04 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  56.72 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.29 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 267 aa  263  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.15 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.15 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.15 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  53.25 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.8 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  55.24 
 
 		 275 aa  262  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.96 
 
 		 247 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.74 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.15 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2015  ABC transporter related  54.18 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0371  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  54.18 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.97 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  55.24 
 
 		 243 aa  261  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.24 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  55.1 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.15 
 
 		 250 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.15 
 
 		 250 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  55.14 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.74 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  54.88 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  52.24 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  51.21 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  56.79 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.74 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.66 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  53.88 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  56 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.55 
 
 		 247 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.56 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  53.06 
 
 		 243 aa  258  7e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0870  ABC transporter related  53.39 
 
 		 269 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.74 
 
 		 250 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.6 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  52.65 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  54.44 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  51.39 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  54.03 
 
 		 265 aa  255  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>