More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2441 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  70.37 
 
 		 243 aa  345  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  68.09 
 
 		 262 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  67.66 
 
 		 246 aa  321  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  66.8 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  64.41 
 
 		 246 aa  312  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  65 
 
 		 243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  66.11 
 
 		 242 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  65.53 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  67.49 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  63.45 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  60.5 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  66.38 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  61.34 
 
 		 252 aa  298  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  60.5 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  60 
 
 		 242 aa  294  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  61.63 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  60.16 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  60.94 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  57.5 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.37 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  59.24 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  60.09 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  60.5 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  58.82 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  59 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  56.67 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  56.25 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  60.76 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  57.56 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  60.34 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.94 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  58.8 
 
 		 245 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  59.92 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  56.79 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.37 
 
 		 249 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.32 
 
 		 278 aa  277  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.87 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.65 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  57.39 
 
 		 506 aa  275  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.56 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  54.62 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  57.45 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.79 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  54.66 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  57.83 
 
 		 249 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  57.39 
 
 		 249 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  57.39 
 
 		 249 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54.15 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.02 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  53.09 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.89 
 
 		 248 aa  268  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.79 
 
 		 240 aa  267  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.08 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  54.15 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  56.41 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.39 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.6 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  53.94 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  53.33 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.88 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  55.51 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  53.44 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  52.63 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  57.14 
 
 		 245 aa  264  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.81 
 
 		 257 aa  264  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  58.55 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.89 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.16 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.23 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.34 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.97 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.61 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54.84 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  52.96 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  52.96 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  58.3 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  52.96 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.74 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  52.96 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  52.96 
 
 		 259 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.81 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>