More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3187 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  94.76 
 
 		 506 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  91.43 
 
 		 247 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  88.98 
 
 		 247 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  89.39 
 
 		 247 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  87.6 
 
 		 243 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  85.95 
 
 		 243 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  71.49 
 
 		 242 aa  363  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  70.95 
 
 		 242 aa  362  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  65.15 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  65.15 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  64.32 
 
 		 245 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 244 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  63.07 
 
 		 244 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  61.83 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  63.27 
 
 		 245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  64.08 
 
 		 245 aa  308  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  61.98 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  60.17 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  62.1 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  60.33 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  61.98 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  61.57 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  61.57 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  62.35 
 
 		 245 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  61.94 
 
 		 245 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  61.76 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  58.58 
 
 		 262 aa  298  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  63.45 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  60.92 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  56.67 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  57.72 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  58.68 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  56.9 
 
 		 246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  59.34 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  59.34 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  277  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  56.8 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.62 
 
 		 249 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.97 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.07 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.09 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.83 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.32 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  55.04 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.17 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.67 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.2 
 
 		 242 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.72 
 
 		 243 aa  267  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  56.38 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.28 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  52.94 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  53.97 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.82 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.72 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  55.51 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.78 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  54.66 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  54.84 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  54.2 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.3 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  51.69 
 
 		 265 aa  264  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.5 
 
 		 246 aa  264  8.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  54.17 
 
 		 256 aa  264  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.39 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  53.56 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.94 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  52.7 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  53.36 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.3 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  52.92 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.39 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.79 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.87 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  53.94 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.97 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  54.17 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  51.88 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  53.53 
 
 		 259 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.66 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.33 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  57.56 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>