More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0208 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  90.2 
 
 
245 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  88.16 
 
 
245 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  88.57 
 
 
245 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  86.69 
 
 
248 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  76.64 
 
 
244 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  75.1 
 
 
244 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  74.69 
 
 
243 aa  374  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.69 
 
 
244 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  74.69 
 
 
245 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  67.77 
 
 
241 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  66.8 
 
 
241 aa  325  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  63.27 
 
 
242 aa  323  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  66.12 
 
 
249 aa  321  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  65.71 
 
 
249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  65.71 
 
 
249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  63.82 
 
 
242 aa  319  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  65.29 
 
 
241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  64.61 
 
 
246 aa  318  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  63.52 
 
 
252 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  64.49 
 
 
243 aa  315  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  63.11 
 
 
261 aa  311  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  63.97 
 
 
243 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  64.08 
 
 
248 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.08 
 
 
248 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  63.97 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  63.67 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  62.3 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  62.86 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  65.24 
 
 
506 aa  299  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  60.91 
 
 
243 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  61.63 
 
 
243 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  60.49 
 
 
252 aa  291  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  59.26 
 
 
252 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  61 
 
 
244 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  59.09 
 
 
262 aa  278  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.79 
 
 
244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.75 
 
 
248 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  59.17 
 
 
248 aa  274  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.55 
 
 
249 aa  274  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  57.96 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  59.57 
 
 
239 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
244 aa  267  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.72 
 
 
239 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  58.26 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  59.92 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.58 
 
 
263 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.54 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  56.56 
 
 
254 aa  265  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  56 
 
 
268 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  58.12 
 
 
257 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
240 aa  262  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  52.99 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  59.17 
 
 
248 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
250 aa  260  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.39 
 
 
252 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.89 
 
 
243 aa  260  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.31 
 
 
246 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56 
 
 
267 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  55.19 
 
 
242 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.73 
 
 
244 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
250 aa  258  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
250 aa  258  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.39 
 
 
242 aa  258  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
250 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  58.47 
 
 
250 aa  258  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  51.39 
 
 
256 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.31 
 
 
242 aa  258  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.56 
 
 
250 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  58.44 
 
 
254 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.56 
 
 
250 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.08 
 
 
240 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.05 
 
 
250 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
242 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  54.84 
 
 
261 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.56 
 
 
250 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  56.79 
 
 
242 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  54.39 
 
 
243 aa  255  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  52.85 
 
 
282 aa  255  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  53.09 
 
 
241 aa  255  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.87 
 
 
243 aa  255  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  53.97 
 
 
243 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.05 
 
 
250 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  53.28 
 
 
254 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.87 
 
 
243 aa  254  7e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  53.28 
 
 
254 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  52.05 
 
 
247 aa  254  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  53.28 
 
 
247 aa  254  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.11 
 
 
242 aa  254  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  51.65 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  52.7 
 
 
244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  54.66 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  52.07 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.69 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.8 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>