More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0303 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  87.97 
 
 		 245 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  87.14 
 
 		 244 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  86.67 
 
 		 244 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  86.31 
 
 		 244 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  74.69 
 
 		 245 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  72.54 
 
 		 245 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  72.13 
 
 		 245 aa  361  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  71.72 
 
 		 245 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  70.16 
 
 		 248 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  68.05 
 
 		 242 aa  349  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  70.54 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  70.12 
 
 		 249 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  70.12 
 
 		 249 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  68.2 
 
 		 241 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  68.62 
 
 		 241 aa  333  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  66.95 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  65.84 
 
 		 246 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  66.94 
 
 		 255 aa  329  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  64.73 
 
 		 242 aa  325  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  65.15 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  64.32 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  63.37 
 
 		 243 aa  321  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  64.46 
 
 		 252 aa  320  9.000000000000001e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  64.32 
 
 		 247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  64.32 
 
 		 247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  63.79 
 
 		 243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  63.07 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  64.78 
 
 		 506 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  61.41 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  60.58 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  61.92 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  63.09 
 
 		 239 aa  292  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  59.58 
 
 		 244 aa  288  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.9 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  60.08 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  58.09 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.58 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.9 
 
 		 239 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  60.34 
 
 		 262 aa  281  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.23 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.5 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  57.26 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  55.23 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.9 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.32 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.54 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.85 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  58.16 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 240 aa  274  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.23 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.65 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  55.65 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.74 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  56.43 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.43 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.81 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  56.9 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.14 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.67 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.49 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.49 
 
 		 242 aa  271  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.96 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  54.17 
 
 		 251 aa  269  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  54.94 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  59.48 
 
 		 257 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  55.19 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  54.77 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.43 
 
 		 246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.8 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  54.22 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.62 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.3 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.79 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  53.33 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  55.88 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.94 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  58.16 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  54.55 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.56 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  53.56 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  55.04 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.85 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  55.23 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  52.08 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  55.65 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.23 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  55.65 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>