More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  98.33 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  74.9 
 
 		 240 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  75.73 
 
 		 241 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  67.5 
 
 		 240 aa  345  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  64.47 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.16 
 
 		 246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  57.74 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 247 aa  278  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.67 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  57.32 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.32 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  56.9 
 
 		 245 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  56.9 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  55.83 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  55.83 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  56.25 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  56.9 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  55.83 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.58 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.42 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.5 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  56.49 
 
 		 262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.42 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.58 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.17 
 
 		 246 aa  266  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  54.58 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.58 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  56.67 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  52.72 
 
 		 247 aa  265  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.78 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  55.83 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  55.23 
 
 		 265 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  54.58 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.25 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  53.66 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  56.1 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  55 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  57.2 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  56.78 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.75 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  53.75 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.75 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 		 241 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  53.33 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.75 
 
 		 242 aa  262  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.14 
 
 		 246 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  55.83 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  55.27 
 
 		 246 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  56.25 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  52.5 
 
 		 242 aa  261  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.74 
 
 		 278 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  56.78 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  53.28 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  53.75 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.33 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.19 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.33 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.36 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.36 
 
 		 242 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  53.56 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  54.81 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  54.66 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  53.85 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.39 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  55.83 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  52.92 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  55 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.09 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  55.19 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  54.36 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  54.81 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.17 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  55.74 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.5 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.5 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>