More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3475 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  80 
 
 		 255 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  77.92 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  72.92 
 
 		 252 aa  361  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  72.92 
 
 		 241 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  71.78 
 
 		 252 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  71.25 
 
 		 241 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  70 
 
 		 241 aa  348  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  69.67 
 
 		 252 aa  348  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  67.63 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  65.84 
 
 		 243 aa  332  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  66.12 
 
 		 244 aa  331  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  66.53 
 
 		 245 aa  331  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.7 
 
 		 244 aa  328  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  64.32 
 
 		 242 aa  324  9e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  64.58 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  64.61 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  65.29 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  64.88 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  64.88 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  64.61 
 
 		 245 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  64.2 
 
 		 245 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  64.41 
 
 		 243 aa  312  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  62.6 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  62.24 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  62.14 
 
 		 245 aa  308  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  60.17 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  60.58 
 
 		 243 aa  305  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  62.76 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  60.92 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  59.75 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  60.17 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  61.76 
 
 		 262 aa  298  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.08 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.33 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  60.26 
 
 		 506 aa  290  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  58.58 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  57.85 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.85 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.58 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  58.85 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  58.12 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  58.4 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  58.09 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.08 
 
 		 244 aa  278  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  57.85 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  58.09 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  60.08 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.26 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.02 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  56.07 
 
 		 252 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.26 
 
 		 246 aa  274  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  56.61 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  56.54 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  58 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.17 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  57.38 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  57.85 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.43 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 		 247 aa  271  9e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  57.98 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  56.49 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  53.23 
 
 		 256 aa  268  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.2 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  54 
 
 		 266 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  56.43 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.33 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  55.23 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.42 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  53.53 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.37 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  54.29 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.54 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  54.47 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59 
 
 		 246 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.08 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  55.27 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  56.73 
 
 		 254 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  56.07 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>