More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2076 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  487  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  82.92 
 
 
241 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  81.74 
 
 
241 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  70 
 
 
246 aa  348  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  70.46 
 
 
261 aa  338  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  69.62 
 
 
255 aa  338  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  68.62 
 
 
243 aa  333  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  67.35 
 
 
248 aa  329  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  66.8 
 
 
245 aa  325  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.53 
 
 
244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  66.53 
 
 
245 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  66.11 
 
 
244 aa  324  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  66.8 
 
 
245 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  66.8 
 
 
245 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  65.98 
 
 
245 aa  321  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  63.6 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  65.69 
 
 
244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  65.27 
 
 
252 aa  314  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  65.42 
 
 
252 aa  314  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  64.85 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  65.27 
 
 
252 aa  312  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  64.44 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  64.44 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  61.34 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  60.5 
 
 
243 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  63.45 
 
 
243 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  63.03 
 
 
243 aa  298  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  60.67 
 
 
243 aa  298  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  63.03 
 
 
247 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.45 
 
 
248 aa  295  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  63.45 
 
 
248 aa  295  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  62.61 
 
 
247 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  60.92 
 
 
247 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  58.16 
 
 
244 aa  281  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  62.61 
 
 
506 aa  280  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  58.65 
 
 
262 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  57.98 
 
 
247 aa  277  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  58.82 
 
 
243 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.56 
 
 
244 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  59.66 
 
 
243 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  58.47 
 
 
241 aa  275  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  59.05 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.38 
 
 
249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  57.81 
 
 
246 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  55.51 
 
 
251 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  56.07 
 
 
240 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.7 
 
 
240 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.72 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.08 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  56.72 
 
 
247 aa  268  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.51 
 
 
240 aa  268  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.43 
 
 
244 aa  266  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  58.9 
 
 
243 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.85 
 
 
241 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.2 
 
 
240 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.43 
 
 
248 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.81 
 
 
240 aa  265  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
240 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  53.62 
 
 
247 aa  264  7e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55.23 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.78 
 
 
240 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  54.01 
 
 
265 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  58.72 
 
 
262 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.63 
 
 
278 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.78 
 
 
240 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  55.93 
 
 
251 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  55.93 
 
 
251 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.43 
 
 
240 aa  262  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.24 
 
 
240 aa  262  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.43 
 
 
242 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.93 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  54.01 
 
 
249 aa  261  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  54.66 
 
 
243 aa  261  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.27 
 
 
244 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.36 
 
 
239 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.39 
 
 
242 aa  260  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  55.7 
 
 
242 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.78 
 
 
240 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  57.02 
 
 
269 aa  260  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.69 
 
 
259 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.01 
 
 
248 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.56 
 
 
246 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.62 
 
 
242 aa  259  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.01 
 
 
246 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  53.04 
 
 
275 aa  259  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  56.3 
 
 
242 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
244 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  55.7 
 
 
256 aa  259  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  54.85 
 
 
242 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
240 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.89 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.81 
 
 
246 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 
244 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 
244 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  56.96 
 
 
242 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.43 
 
 
243 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.66 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.62 
 
 
242 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
253 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.43 
 
 
243 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>