More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1514 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  68.78 
 
 		 241 aa  349  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  68.2 
 
 		 240 aa  346  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  67.5 
 
 		 240 aa  345  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 240 aa  341  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  63.45 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.83 
 
 		 240 aa  294  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  55.42 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.75 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.83 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 251 aa  278  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.42 
 
 		 242 aa  277  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  57.32 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  56.49 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.08 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  56.9 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.42 
 
 		 246 aa  274  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.75 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.9 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  56.49 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.79 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.65 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.5 
 
 		 278 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.47 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  53.33 
 
 		 240 aa  269  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.33 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.58 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  54.92 
 
 		 260 aa  268  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  54.17 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  53.88 
 
 		 248 aa  267  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55 
 
 		 242 aa  267  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  55 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  55.83 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.75 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  53.53 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  54.58 
 
 		 246 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  56.49 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  53.75 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  53.94 
 
 		 243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 273 aa  265  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  54.17 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.23 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  52.92 
 
 		 265 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  54.07 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  55.83 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 258 aa  264  8e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 		 257 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  54.81 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  55.51 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  57.08 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  54.58 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.61 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.23 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  56.02 
 
 		 241 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  54.39 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.83 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>