More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3307 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  530  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  87.5 
 
 
250 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  75.89 
 
 
260 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  73.02 
 
 
260 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  69.46 
 
 
249 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  61.32 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  61.16 
 
 
336 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  58.8 
 
 
269 aa  294  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.17 
 
 
278 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.51 
 
 
261 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  58 
 
 
252 aa  287  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 
278 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.92 
 
 
240 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 
246 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 
244 aa  285  7e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.83 
 
 
240 aa  285  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  60.57 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  58.1 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.25 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  57.26 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  57.33 
 
 
249 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  56.5 
 
 
272 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.17 
 
 
243 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.84 
 
 
242 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.58 
 
 
243 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.79 
 
 
243 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.26 
 
 
243 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.85 
 
 
243 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.42 
 
 
243 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.17 
 
 
243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.98 
 
 
242 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  56.68 
 
 
257 aa  275  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.55 
 
 
244 aa  275  6e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  57.38 
 
 
246 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  54.98 
 
 
254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.43 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.19 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.17 
 
 
242 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  58.58 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  53.94 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.25 
 
 
244 aa  271  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  58.94 
 
 
251 aa  271  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  271  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 
251 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  52.92 
 
 
244 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  56.15 
 
 
246 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  57.44 
 
 
243 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  58.55 
 
 
243 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
244 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  58.2 
 
 
255 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  55 
 
 
241 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 
240 aa  269  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
240 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  54.81 
 
 
247 aa  269  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
240 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
240 aa  268  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
240 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
240 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  54.58 
 
 
241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
241 aa  268  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.55 
 
 
241 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.55 
 
 
241 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
240 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  55.33 
 
 
246 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
266 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.68 
 
 
257 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 
240 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  55.83 
 
 
249 aa  267  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  54.88 
 
 
247 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.17 
 
 
259 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 
240 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  53.75 
 
 
240 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  55.65 
 
 
265 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  54.96 
 
 
251 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.8 
 
 
258 aa  266  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  54.13 
 
 
241 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  54.18 
 
 
254 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  55.21 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  54.32 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  55.56 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  52.94 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.56 
 
 
240 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  56.67 
 
 
243 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  53.53 
 
 
246 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  53.17 
 
 
254 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 
240 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
267 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.67 
 
 
242 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
240 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  52.82 
 
 
265 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  55.28 
 
 
260 aa  265  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
242 aa  265  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.33 
 
 
246 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.67 
 
 
278 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.55 
 
 
260 aa  263  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.33 
 
 
249 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>