More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2630 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  73.74 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  78.6 
 
 		 269 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  77.08 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  76.77 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  71.08 
 
 		 278 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  70.42 
 
 		 261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  59.35 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  57.94 
 
 		 250 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  60.57 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  57.38 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.61 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  56.02 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.97 
 
 		 242 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.56 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.05 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.5 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  52.82 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  53.66 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  54.07 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  54.77 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  53.91 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.8 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  53.23 
 
 		 247 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.91 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  52.87 
 
 		 241 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 		 251 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  51.24 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  54.55 
 
 		 243 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.67 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  54.07 
 
 		 253 aa  254  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  54.55 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  50.61 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.3 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.3 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.31 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.3 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  53.47 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  53.47 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  52.23 
 
 		 253 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  52.55 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  52.89 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  50.62 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.31 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  50.62 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 241 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.69 
 
 		 242 aa  252  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.32 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 244 aa  252  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  54.07 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 240 aa  251  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  53.31 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  51.19 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  50.21 
 
 		 241 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.44 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.45 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.21 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  53.56 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  49.38 
 
 		 242 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  49.38 
 
 		 242 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.26 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.36 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.59 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  50.83 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  53.31 
 
 		 243 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  54.73 
 
 		 253 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 244 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 244 aa  249  5e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.66 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  51.65 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.36 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.44 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  54.1 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.44 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  53.36 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  52.72 
 
 		 245 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  52.72 
 
 		 245 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 242 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  51.03 
 
 		 247 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  51.85 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>