More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3163 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.74 
 
 		 278 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  77.78 
 
 		 269 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  76.73 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  76.56 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  70.04 
 
 		 278 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  65.73 
 
 		 261 aa  328  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  57.32 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.38 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  57.85 
 
 		 260 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  56.5 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  57.44 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.92 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  51.79 
 
 		 254 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  54.8 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.06 
 
 		 250 aa  262  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  53.09 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  51.44 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  51.44 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  54.51 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.78 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  54.77 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.13 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  52.36 
 
 		 271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.55 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.32 
 
 		 242 aa  258  9e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.25 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.96 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.46 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  54.44 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  51.88 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.13 
 
 		 242 aa  255  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.8 
 
 		 244 aa  255  6e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  54.07 
 
 		 266 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.09 
 
 		 244 aa  254  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  54.07 
 
 		 247 aa  254  9e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  52.24 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  53.53 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  52.85 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.28 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  51.23 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.41 
 
 		 254 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.72 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  50.2 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  51.43 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.65 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  52.67 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  53.25 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.83 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  52.87 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1038  ABC transporter related  54.47 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.841367  normal  0.084671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 240 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  50.81 
 
 		 259 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  52.89 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  50.61 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  52.07 
 
 		 242 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.65 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  51.6 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  50.83 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.65 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  50.41 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  52.74 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  51.02 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  51.85 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  51.64 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  53.04 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  49.79 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  51.63 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  50.62 
 
 		 246 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  52.94 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  51.64 
 
 		 243 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.78 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  52.46 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 		 247 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  52.23 
 
 		 254 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  54.55 
 
 		 243 aa  248  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.56 
 
 		 249 aa  248  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  49.8 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  50.83 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.24 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4075  ABC transporter related  52.8 
 
 		 256 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  52.94 
 
 		 241 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  54.62 
 
 		 241 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 		 245 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  49.22 
 
 		 363 aa  248  9e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  53.63 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 254 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  52.38 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 242 aa  248  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>