More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5772 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  100 
 
 		 336 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  79.44 
 
 		 286 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.62 
 
 		 278 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  76.38 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  74.9 
 
 		 269 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  68.66 
 
 		 278 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  69.67 
 
 		 261 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  61.57 
 
 		 250 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  61.16 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  58.59 
 
 		 260 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  60.91 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.85 
 
 		 256 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.26 
 
 		 246 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.38 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.49 
 
 		 242 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 		 240 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 253 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  54.51 
 
 		 260 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.02 
 
 		 244 aa  264  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.81 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  53.61 
 
 		 253 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  54.69 
 
 		 266 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  55.37 
 
 		 243 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.56 
 
 		 244 aa  262  6.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  54.69 
 
 		 266 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  53.94 
 
 		 262 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.31 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 244 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.51 
 
 		 278 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  50 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  55.79 
 
 		 243 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  57.02 
 
 		 243 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  51.24 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 		 241 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.04 
 
 		 240 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  53.53 
 
 		 269 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.66 
 
 		 251 aa  258  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.55 
 
 		 242 aa  258  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  52.8 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 		 244 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.85 
 
 		 249 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  54.96 
 
 		 243 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  52.11 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.65 
 
 		 241 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.65 
 
 		 241 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 		 241 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  54.88 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  52.89 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.65 
 
 		 267 aa  256  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 242 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.24 
 
 		 241 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.3 
 
 		 248 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  50.83 
 
 		 243 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.83 
 
 		 240 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  51.65 
 
 		 240 aa  255  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  51.81 
 
 		 241 aa  255  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  52.87 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.96 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  55.78 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.46 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.46 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  53.25 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  52.46 
 
 		 241 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  53.5 
 
 		 243 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 		 261 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  55.17 
 
 		 248 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.5 
 
 		 244 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  50.41 
 
 		 243 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.01 
 
 		 244 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  50.41 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  51.22 
 
 		 247 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.17 
 
 		 243 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.78 
 
 		 256 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  52 
 
 		 260 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  53.5 
 
 		 243 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  53.82 
 
 		 273 aa  252  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.31 
 
 		 245 aa  252  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  54.76 
 
 		 255 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.44 
 
 		 244 aa  252  7e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  56.3 
 
 		 243 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.42 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>