More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5173 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  69.67 
 
 		 336 aa  345  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.42 
 
 		 278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  64.96 
 
 		 269 aa  328  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  65.73 
 
 		 272 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  66.14 
 
 		 286 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  63.67 
 
 		 278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  60.67 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  60.08 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  59.83 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  58.51 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.56 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.49 
 
 		 242 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.83 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.2 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  57.56 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.5 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.87 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.09 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  54.17 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.1 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  54.17 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.97 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  52.44 
 
 		 249 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  53.33 
 
 		 243 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  52.46 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.33 
 
 		 243 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  53.41 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  53.56 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.56 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.94 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.52 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  51.15 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.72 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  52.92 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.28 
 
 		 251 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.36 
 
 		 239 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.31 
 
 		 240 aa  258  9e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  53.31 
 
 		 242 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  51.43 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.07 
 
 		 254 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  54.36 
 
 		 240 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  52.7 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  50.41 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.4 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  52.26 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.54 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  55.04 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  51.46 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  52.89 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  51.46 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  54.18 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.56 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  53.33 
 
 		 252 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  53.94 
 
 		 246 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  54.58 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  54.39 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.11 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  53.25 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  51.68 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  52.07 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  53.78 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  52.85 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  52.82 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  51.23 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.36 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  51 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  54.36 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  48.79 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  50.63 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.42 
 
 		 240 aa  252  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  50.63 
 
 		 246 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 240 aa  252  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  53.53 
 
 		 241 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>