More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5544 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  95.85 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  81.74 
 
 		 241 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  71.25 
 
 		 246 aa  352  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  69.62 
 
 		 255 aa  335  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  66.95 
 
 		 243 aa  332  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  67.36 
 
 		 244 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  69.2 
 
 		 261 aa  330  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.39 
 
 		 244 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  66.53 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  65.27 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  65.27 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  65.69 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  65.27 
 
 		 249 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  65.27 
 
 		 249 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  65.29 
 
 		 245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  64.08 
 
 		 248 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  65.29 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  65.29 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  64.05 
 
 		 245 aa  315  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  64.85 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  63.18 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  63.18 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  62.61 
 
 		 243 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  60.67 
 
 		 242 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.92 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  60.5 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  60.92 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  60.08 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  58.09 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  59 
 
 		 247 aa  284  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  59.24 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  57.63 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.82 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  60 
 
 		 506 aa  278  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.12 
 
 		 244 aa  276  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  56.9 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.27 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55.7 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  55.7 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55.83 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.88 
 
 		 249 aa  271  9e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.14 
 
 		 244 aa  269  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  54.85 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.85 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  55.88 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.01 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  56.6 
 
 		 269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  57.63 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  56.96 
 
 		 246 aa  267  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 242 aa  267  8.999999999999999e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  57.45 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.62 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.78 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.88 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  52.63 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  56.3 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.51 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  57.38 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.43 
 
 		 243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  56.78 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  53.59 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  55.27 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.45 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.27 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  265  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  53.39 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.08 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.93 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.17 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  56.3 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.78 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.85 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.01 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.01 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  54.62 
 
 		 242 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  56.54 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.24 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  52 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.97 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.43 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  53.14 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  54.43 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  53.14 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.39 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.27 
 
 		 249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.32 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  56.75 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>