More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3129 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  76.99 
 
 		 242 aa  348  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  70.12 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  69.58 
 
 		 242 aa  340  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  66 
 
 		 262 aa  337  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  67.9 
 
 		 244 aa  334  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  67.08 
 
 		 246 aa  334  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  65.98 
 
 		 243 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  62.76 
 
 		 243 aa  311  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  66.38 
 
 		 243 aa  309  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  61.44 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  60.08 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  59.92 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  59.83 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  59.48 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  56.36 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  58 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  59.41 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  59.41 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  57.68 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.9 
 
 		 249 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  57.74 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  57.81 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  57.89 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  57.68 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  56.49 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  57.89 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  56.49 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  57.49 
 
 		 245 aa  274  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.39 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.2 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  56.54 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  56.9 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  56.12 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 		 261 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  54.44 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  55 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  55.33 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.01 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  54.39 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.91 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  53.97 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  56.12 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  54.39 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  52.74 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  53.22 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  52.7 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.74 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.33 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55 
 
 		 243 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.51 
 
 		 278 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.04 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  56.43 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.62 
 
 		 592 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.23 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.73 
 
 		 594 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.17 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.08 
 
 		 240 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.73 
 
 		 594 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.3 
 
 		 242 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  54.22 
 
 		 242 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  251  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  53.28 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 		 598 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  55.24 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  54.81 
 
 		 245 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.98 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  54.58 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  53.36 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54.43 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.39 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  53.94 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.89 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  50.6 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  51.04 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  55.1 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  53.94 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.34 
 
 		 242 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  53.74 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.24 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  53.33 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  55.92 
 
 		 619 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>