More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4668 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  76.02 
 
 		 246 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  72.2 
 
 		 243 aa  358  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  68.62 
 
 		 242 aa  343  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  68.6 
 
 		 244 aa  342  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  67.22 
 
 		 243 aa  334  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  68.09 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  66 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  64.58 
 
 		 242 aa  318  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  67.36 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  62.5 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  61.76 
 
 		 246 aa  298  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 248 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  58.58 
 
 		 248 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  63.56 
 
 		 239 aa  298  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  61.25 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  62.08 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  56.07 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.75 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  56.07 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  59.83 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  59.83 
 
 		 249 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  59.83 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  56.07 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  58.82 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 		 247 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  59.83 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  59.66 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  59 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  57.58 
 
 		 506 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  58.37 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  58.26 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  60.34 
 
 		 243 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  57.74 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  59.83 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  59.09 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  58.65 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  57.44 
 
 		 245 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  58.47 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  56.12 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  57.02 
 
 		 245 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  55.7 
 
 		 241 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.3 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.92 
 
 		 249 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  55.82 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  53.5 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.75 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.5 
 
 		 243 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  56.35 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.78 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.07 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.58 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.08 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  55.46 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  54.44 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.66 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.59 
 
 		 246 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  52.97 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.17 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.08 
 
 		 243 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  55.14 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.08 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  56.2 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  56.2 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  54.36 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  55.46 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  52.5 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.56 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  53.81 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  54.37 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 240 aa  258  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  55.12 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.17 
 
 		 253 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  55.14 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.39 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  55.78 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.33 
 
 		 242 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  54.78 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  51.81 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>