More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2072 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  69.92 
 
 		 244 aa  338  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  69.01 
 
 		 242 aa  333  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  69.58 
 
 		 257 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  65.42 
 
 		 246 aa  324  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  64.58 
 
 		 262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  64.88 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  67.36 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  63.6 
 
 		 243 aa  307  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  65.53 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  61.86 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  54.58 
 
 		 243 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.04 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  57.98 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.72 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  55.93 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  57.56 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  54.2 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  53.14 
 
 		 242 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  56.25 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  53.78 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  54.58 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.11 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.7 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  55 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  51.9 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.98 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  52.3 
 
 		 257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.04 
 
 		 249 aa  258  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 		 261 aa  257  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  54.58 
 
 		 249 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.94 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  52.72 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  51.49 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  53.36 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  56.36 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  54.17 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  53.36 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  53.33 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  52.92 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  54.17 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  54.17 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  56.79 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  52.72 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  54.39 
 
 		 252 aa  254  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  54.63 
 
 		 506 aa  254  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  54.88 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.02 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.89 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.16 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  53.75 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.1 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  52.32 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  54.2 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  49.37 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  49.37 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 242 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.66 
 
 		 243 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  55.65 
 
 		 245 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  52.5 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  52.5 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  54.01 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.58 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.4 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.42 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  54.01 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.94 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.27 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  52.3 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.69 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.59 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  50.42 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  52.74 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  55.88 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  51.46 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.31 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  52.72 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  50.99 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.64 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.67 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.89 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  52.97 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.36 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  51.67 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.5 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  53.36 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>