More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1706 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  76.35 
 
 		 257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  73.55 
 
 		 242 aa  353  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  67.36 
 
 		 262 aa  333  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  67.62 
 
 		 244 aa  331  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  67.78 
 
 		 246 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  67.36 
 
 		 242 aa  322  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  66.25 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  67.49 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  63.18 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.17 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.09 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  62.76 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  58.82 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.09 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  58.47 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  59.24 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  60.82 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.92 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.98 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  60.5 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  58.75 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  60.08 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  60.08 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.26 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  58.05 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  56.85 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  278  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  58.16 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.81 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 247 aa  276  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  57.56 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  56.72 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.92 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  59.75 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  55.7 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.14 
 
 		 249 aa  274  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56.54 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.45 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  58.62 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  57.2 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  57.2 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  56.12 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.72 
 
 		 249 aa  271  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  57.81 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  58.16 
 
 		 249 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  56.67 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  58.16 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.38 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  57.81 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  59.04 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.42 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  59.05 
 
 		 244 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  55.93 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.2 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  269  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  55.93 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.81 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  269  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  57.74 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  57.2 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  269  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  56.9 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  58.47 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.76 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.32 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.61 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  58.05 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  56.96 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  57.2 
 
 		 243 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  57.33 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  56.02 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  56.72 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.67 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  56.02 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.19 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  53.56 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.93 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.66 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.19 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.36 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  58.9 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  56.78 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>