More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0176 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  496  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  71.55 
 
 		 246 aa  351  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  68.62 
 
 		 262 aa  343  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  68.85 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  73.55 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  69.01 
 
 		 242 aa  333  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  70.12 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  66.11 
 
 		 243 aa  329  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  66.11 
 
 		 243 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  63.33 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  59.32 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  57.08 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  56.67 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  54.24 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  56.67 
 
 		 252 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  56.91 
 
 		 249 aa  271  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.59 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  53.78 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  56.07 
 
 		 255 aa  268  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.17 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  267  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  55.04 
 
 		 242 aa  267  8.999999999999999e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.73 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.11 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  53.94 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  53.75 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  55.19 
 
 		 245 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  53.36 
 
 		 243 aa  264  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  56.96 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  53.36 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  55.46 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  54.39 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.16 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  53.33 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  55.46 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.74 
 
 		 249 aa  262  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  55.04 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  55.04 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.54 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  54.62 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  55.19 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  55.19 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  56.67 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  54.62 
 
 		 241 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  53.36 
 
 		 245 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.72 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  52.52 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3156  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.805014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3270  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  54.88 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1404  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.595222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  53.39 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2389  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.56 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  54.66 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  55.19 
 
 		 245 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1124  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2355  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  55.19 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2096  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1485  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.89 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  55.6 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  52.92 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  54.62 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  53.14 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  53.36 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  51.68 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.99 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.18 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.07 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>